财政部发布2011年第63号公告，公告了45个中央行政事业单位2009年至2010年上半年预算资产财务情况检查结果。结果显示，各行政事业单位均建立了内部控制制度或者其内部控制制度比较健全，但其在预算、资产、财务管理等方面各存在不同的问题。

被查单位预算资产财务管理上存在以下五方面的问题：一是会计机构不健全，会计人员配备不足，个别单位会计基础工作薄弱；二是预算编制和执行不够规范；三是一些单位资产管理基础薄弱，固定资产核算不实等问题较为突出；四是部分事项的会计核算不实；五是在执行税收、津贴补贴、非税收入等国家政策过程中还有不够规范的方面和环节。

对45个单位的检查结果进行总结表明，行政单位预算资产财务管理较事业单位规范，问题相对较少，高校及科研院所预算资产财务管理较为薄弱，预算编制不完整不真实、财务管理问题比较突出，个别高校还存在“小金库”等严重问题。

对检查发现的问题，财政部已依法下发处理决定，责成被查单位调账补税、加强管理、追究相关人员责任等。

截至2011年7月底，大部分问题已整改到位，已有2名责任人被依法追究了相应的责任。

财政部监督检查局有关负责人表示，今后主要从以下几方面加强中央行政事业单位财政监督：一是围绕财政中心工作，继续做好中央行政事业单位预算资产财务检查。通过有针对性的专项检查，发现并纠正中央行政事业单位财政财务管理存在的问题，提出完善有关财政政策的意见和建议；二是积极推进中央基层预算单位综合财政监管，建立专员办对中央基层预算单位的横向监管机制，保障各项财政管理事项合规运行；三是加大信息公开力度，将检查情况通过多种方式向社会公开，满足人民群众的知情权、参与权、监督权；四是加强对中央行政事业单位有关人员的培训，及时宣传财政财务管理方面的最新政策制度，保障各项政策规定落实到位。

以上45个中央行政事业单位包括国家税务总局、海关总署、质检总局、煤矿安全监察局、气象局等部门所属的28个二级预算单位以及13所中央高校和4个科研院所。