核算中心内部会计控制体系的建立与健全，对于保证各核算单位的资金安全大有裨益会计集中核算是集监督管理和服务为一体的新型核算模式，与传统的分户核算在操作流程、人员管理、会计职能和部门利益上都有本质区别，原来分户核算下的内部会计控制制度已经不能适应集中核算模式。在集中核算模式下，如何完善内部会计控制体系，更好地发挥内部会计控制应有的保证作用，成为当前亟须解决的一个问题。
　　 结合单位实际，笔者认为，集中核算是围绕着核算中心开展的，核算中心应根据自身特点科学合理地设置内部机构和工作岗位，明确各部门权限，细化岗位职责,形成完整的内部牵制和监督约束机制。
　　 此外，规范核算流程，严格执行牵制、稽核、轮岗等制度是建设核算中心内部会计控制体系的关键；要提高单位负责人对建立和完善内部会计控制制度重要性的认识，结合单位自身特点找到内部控制的弱点，进一步制定完善相应的内控制度。