随着市场经济的建立和高等教育体制改革的深入，我国高校以政府财政拨款为主要经费来源的格局正在被开放型、多元化的筹资办学形式替代，其财务管理的任务也随之有了重大变化。在高等教育快速发展、经济全球化浪潮、知识经济与电子商务等的冲击等大背景下，高校财务管理面临巨大挑战。因此，我们需要不断进行管理创新，适应市场经济体制的要求和财务管理环境的变化，更好地满足现实条件下高校财务管理的需要，这已成为当下高校财务管理必须关注的问题。我们可以预见在今后一段时间内,我国高校财务管理将呈现出以下5种发展趋势。
　　一、高校财务管理的性质呈现多重性
　　属于国家事业单位的公办高校，政府财政拨款是其主要经费来源，这部分经费执行《国家事业经费财务管理办法》。近几年来，随着我国市场经济的进一步发展和高校独立法人地位的确立，高校的办学环境发生了重大变革，财务活动也呈现了许多新的特点。比如高校经费收入多元化，除政府的财政拨款外，其他渠道的筹资比例越来越高，在高校教学和科研事业发展中发挥的作用也越来越重要；高校所面对的经济活动，除满足日常教学、科研等活动所发生的非盈利经济活动外，还有校办产业、后勤服务、科技服务等盈利、半盈利的经济活动。新形势下的高校财务管理既有事业财会的内容,又有企业财会的内容，并且后者所占的份额还将会逐步扩大。随着经费来源渠道多元化格局在高校逐渐形成，投资者及社会各界必将会越来越关注高校办学的成本，相应的高校也必然要更加注重在各项财务活动中的成本效益管理。高校财务管理的性质在新形势下已呈现多重性的特点。
　　二、高校财务管理的目标转变
　　高校财务管理是指对高校资金的运行及各方面财务关系的管理和协调，其目标是财务管理决策者及其财务管理部门进行各项工作最终所要达到的目的或期望实现的效果。随着新的《高等学校财务制度》和《高等学校会计制度》即将实施，我国高等学校也将对现行财务管理体制进行相应的改革。与此同时，我国高校财务管理的目标也将发生转变。财务工作由以核算为中心转变为以管理为中心，财务管理工作成为学校财务工作的中心和重点。近几年来，高校面临各类办学资源的竞争，迫使其在财务上采取一系列应对措施，但无论是走内涵式发展道路，还是实施外延式发展战略，都需要大量的经费作保障。为加快发展，在竞争中取得优势，高校在财务管理上必须以绩效为导向，以实现社会效益和经济效益双赢为目标，梳理经营学校的观念，力求做到经济效益目标与社会效益目标的协调统一、战略性目标与具体目标的有机结合，围绕绩效最大化的目标进行财务管理观念、制度、方式的创新。在这种背景下，高校财务管理的目标已从单纯的以记账式的、资金收、付为中心的微观管理转向以微观管理为基础，重点解决资金筹措、调拨以及提高资金使用效益等宏观管理的轨道上来。高校财务管理的目标必须紧密围绕高校管理的最终目标，并通过开展财务管理工作，促进学校发展目标的实现。
　　三、高校财务管理的内容不断拓宽
　　高校财务管理的内容，随着高校财务管理目标的改变也在不断拓宽，从原来简单的收支管理拓展为全面落实高校各级经济责任制，依法多渠道筹集和科学运用办学资金，完善学校资产配置的约束性机制，科学配置学校资源，防止国有资产的浪费和流失，合理编制预算，并对预算执行过程进行控制和管理，提高学校资金运作效率，健全高校财务制度和内控制度，规范校内经济秩序等等诸多方面。与此同时，高校的资金来源已经从单一国家拨款逐步转向多渠道筹集资金，多渠道资金的来源主要包括联合办学、企业及个人的捐赠、银行及非银行金融机构贷款等方面。不同的筹资方式会带来不同的风险，高校必须加强筹资的管理；通过投资获取收益，增加办学经费，力求以较小的投资风险和较低的投资成本获得较大的投资收益，也是财务管理内容的一个重要方面；伴随高校体制改革的发展，财务管理也不再局限于财政预算资金，以绩效为导向，围绕绩效最大化，采取“成本效益比较”会计理论进行高校成本管理，必然催生出高校培养学生的一套成本核算体系；实行激励分配机制，合理制定分配方案等以上内容也将成为高校财务管理的主要内容。
　　四、高校财务管理的手段和方法更加现代化
　　高校财务管理工作是一项复杂的系统工程，是利用价值形式对高校各项经济业务活动进行的综合性管理。随着科学技术的发展，会计电算化的广泛应用，传统的会计账务处理、信息查询方式等都发生了深刻的变化，以互联网、局域网以及电子商务为背景的在线理财活动，对高校财务工作现代化提供了物质基础。在网络财务环境下,高校的会计实务可以进行远程处理,及时整合处于不同空间的整个高校的财务资源,全面提高高校的竞争力；从时间上看，高校的一切活动均可以实时报告,便于高校进行在线管理,从而显著提高高校财务的管理水平和工作效率。其次,在网络财务环境下,对于拥有众多下属机构和单位的高校来说,可以实现财务与经济业务的协同,从而使高校资源配置最优化,最大限度地节约和使用资源。信息化是我国高校财务管理发展的大趋势，在新形势下只有加强高校财务管理，才能适应高校财务工作现代化的要求，才能使开放化、智能化的高校财务管理系统安全、有序、高效地运转，最终完成高校财务管理任务。
　　五、高校财务管理的风险和压力越来越大
　　近年来，伴随着我国高等教育的发展，在高校进行大规模的“扩招”和“新校区”建设的背景下，很多高校的贷款规模在迅速增大，而大规模的资金筹措、运用及归还给高校财务管理提出了全新的要求。许多高校的财务风险防范意识不强，不能结合学校的实际状况进行投资、筹资，缺乏科学决策,缺乏事前可行性分析、过程控制和事后的收益评价和信息反馈，甚至有为数不少的高校认为，高校是社会公益事业单位，是国家财政拨款单位，高校的贷款等风险可以转嫁到政府身上。
　　另外，我国高校校长实行任期制，极易形成短期行为，对学校还贷的责任也比较模糊。我国高校收入的主要来源是国家财政拨款和学生学费收入，大部分高校均以未来的学费收入和部分财政拨款作为还贷资金的首选来源和主要资金，但国家财政的教育拨款和学费收入的增加要受国家财政收入的增长水平、居民收入水平、收费政策及生源变化等因素的影响，一旦到期不能归还贷款，学校的财务压力就会加大，财务风险就会凸现。在这种状况下如何管好、用好资金，如何应对存在的风险和压力，是高校财务管理面临的严峻挑战。