为了维护与发展现代企业制度，我国相应建立了完善的审计组织体系。根据《中华人民共和国宪法》、《中华人民共和国审计法》和《中华人民共和国注册会计师法》的有关规定，我国组建的审计组织形式，主要由政府审计机关、部门和单位内部审计以及民间审计组织。
　　一、现代企业制度与健全的审计组织体系的关系
　　建立和完善现代企业制度是发展社会主义市场经济的必然要求，也是国有企业改革的重点。现代企业制度大体可包括以下五点内容：企业资产具有明确的实物边界和价值边界，切实承担起相应的出资者责任;企业通常实行公司制度，即有限责任公司和股份有限公司制度;企业以生产经营为主要职能，有明确的盈利目标;企业具有合理的组织结构，在生产、供销、财务等方面形成行之有效的企业内部管理制度和机制;企业有预算约束和合理的财务结构，可以谋求企业的扩展，经营不善难以为继时，可寻求资产和其它生产要素的再配置。
　　现代企业制度下，企业作为经济运行的主体，完全按照市场的需求组织生产和开展经济活动，同时，现代企业制度的重要内涵是所有权对经营权的分离和有效监督。众多的信息使用者都对企业的财务信息有需求，最适当的审计方法应是请处于第三者地位的独立审计主体――社会审计组织做出客观公正的评价。这样才能使所有进入市场的企业都拥有平等的竞争条件。 因此，现代企业制度完善的审计组织体系要求国家审计、内部审计和民间审计共同存在与发展，这样对促进公平竞争、建立科学管理体制有重大意义。
　　二、政府审计
　　政府审计机关是代表政府依法行使审计监督权的行政机关，它具有宪法赋予的独立性和权威性。政府审计机关审计监督活动有合法性、独立性和强制性原则。随着现代经济的进一步发展,中央、地方、部门和企事业组织之间的利益关系发生了重大调整，现存的国家审计制度出现了不适应性，具体表现如下：审计机关的领导机构构成影响了国家审计的独立性。目前，我国地方各级国家审计机关是属于各级政府机关的一个部门机构,同时审计机关还要受本级人民政府和上一级审计机关的领导。由于彼此间具有一定的隶属关系和共同利益，势必会造成审计过程上的非独立性;目前的政府审计对国家的财政金融机构和企事业组织的审计制约了现代企业制度的进一步深入推广。
　　在现代企业制度下，若要解决上述各类问题，使政府更加有效地行使行政职能，需要进行以下几方面的改进：实现审计机关领导机构的转变。将国家审计机关直接归属于全国人民代表大会领导，使国家审计机关不隶属于国务院，从而进一步提高政府审计的独立性。同时，审计部门经费从人民代表大会通过的专款中单独列支，脱离分支审计机构所在地的当地政府机关;根据审计法的有关规定及国外成熟的审计组织体系设置的经验，重新划分国家审计和社会审计的范围。企业审计应全部由社会审计完成,国家审计对会计师事务所提交的审议报告进行审查，即对审计报告进行再次审计。这样符合《审计法》“对国有企业的资产、负债、损益等方面的财务收支的审计监督”的有关规定，加强了国有资产的监督管理，有利于政企分开，使审计机关充分发挥职能作用。国家审计和社会审计的侧重点不同。前者是对真实行、合法性和效益性进行审计，后者是对企业会计报表的公益性、合法性、一贯性和财务收支情况进行审计;国家审计只需要对中央银行及政策性银行的财务收支情况进行审计。通过以上措施完善国家审计，将有利于现代企业制度中的政府职能的转变，提高国家审计的独立性。
　　三、内部审计
　　内部审计是指由部门或单位内部相对独立的审计机关和审计人员对本部门或本单位的财政财务收支、经营管理活动以及经济效益进行审核和评价，查明其真实性、正确性、合法性、合规性和有效性，并提出意见和建议的一种专职经济监督活动。
　　内部审计机构或者审计工作人员对本单位及本单位下属单位的下列事项进行审计监督：财务计划或者单位预算的执行和决算;与财务收支有关的经济活动及其经济效益;国家和单位自产的管理情况;违反国家财经法规的行为;承包、租赁经营的有关审计事项;所在单位领导人交办的和审计机关委托的其它审计事项。
　　我国的内部审计机构，包括部门内部审计机构和单位内部审计机构。虽然我国的内部审计在近些年有了长足的发展，但有两个问题目前仍未得到妥善解决。即：内部审计仍未引起部分国有企业负责人的重视，部门设置不科学，人员配置不充分；我国内部审计从业人员普遍素质不高，缺少相关培训与职称评定。为了解决上述问题，可从以下几方面考虑：提高企业负责人对内部审计重要性的认识。社会主义市场经济条件下，现代企业在经营过程中，为了降低成本，追求效益，健康经营，内部审计是不可缺少的，它能帮助企业负责人监督管理，为企业提供控制信息，有利于企业的决策和发展，如果现代企业的负责人真正领悟到这一点，将有助于内审工作的进一步发展;同时，内部审计机构因为是专职业务，其性质与会计检查并不相同，因此必须单独设立，并受本部门或本单位主要负责人的领导。内审部门不应设在财务部门之内，受财会负责人的领导，因为这样将严重影响内部审计的公正性和独立性;审计机构中人员素质的高低直接影响现代企业内审工作的发展。内部审计部门应该配备知识全面，不仅精通审计、财会专业，而且懂得经营管理方面的知识，并且是为人正直、作风正派，具有良好的形象，能够开展内部审计工作的人员。同时，内审部门还应大力开展所属人员的培训和后续教育，以增强审计部门的执业能力。
　　四、民间审计
　　民间审计又称独立审计、社会审计、注册会师审计，是市场中介组织中的会计师事务所接受单位或个人的委托进行了审计，与单位或个人之间的委托关系是民事关系，承办业务的双方要签订合同和协议，是有偿服务的民事活动。民间审计组织是指根据国家法律和规定，经政府有关部门审核、注册登记的会计师事务所和审计事务所。民间审计实行会计审计业务，应根据审计组准则，按照一定的工作规则，履行必要的审计程序和方法，对被审计单位的财务会计报表和其反映的财务收支以及相关经济活动的公允性、正确性和合法性做出判断和评价。
　　但就目前社会审计的发展情况来分析我国的民间审计还存在以下几个问题需要探讨：建立有效的运行机制。会计师事务所最关键的问题是能不能建立权责利紧密结合的机制，国外会计师事务所的发展历程是，独资→合伙→有限合伙。许多国家的事务所都采取专业服务公司形式，其实质是有限合伙制，这种形式也是中国会计师事务所的发展方向;注册会计师的执业水平有待进一步提高。注册会计师行业是知识密集型行业，会计师事务所应不断吸纳高素质的注册会计师加盟，并允许其以知识资本这个无形资产参股。对事务所的原有从业人员应加强后续教育，更新知识结构，以满足会计师事务所拓展新业务的需要;会计师事务所成立条件较低，规模较小，尚未具有与国际会计师事务所竞争的实力。随着经济全球化趋势不断加强，跨国公司、跨国资源流动正以惊人的速度发展，执业区域全球化则成为必然选择。中国会计师事务所不应坐等国际会计公司侵蚀本国市场，而是应试培养一批具有国际水平的注册会计师，敢于与国际会计公司竞争，并把触角伸到国外去，开拓国际生存空间。
　　五、结论
　　我国审计组织体系是维护现代企业制度的重要保证，政府审计、内部审计与民间审计的有机结合，是我国社会主义市场经济良性发展的必须条件。随着改革开放的进一步发展，政企分开的逐步完成，我国的审计组织体系必将更加健全，并发挥更大的社会作用。