事业单位财务收支管理并非一般日常的财务活动，倘若管理不当，不仅会造成严重超支浪费，而且事关着资金的使用效率。目前我国事业单位的资产性质和职能有多种类型。一是全额补助型，即单位完全承担行政分配的职能；二是差额补助型，即单位既具有行政职能又有组织收入的条件；三是自收自支型，即指完全进入市场靠自身创收生存的事业单位。这种性质的多类型决定了事业单位在财务收支管理方面的不同。鉴于事业单位身份和性质的这种复杂性，加之自身固有的一些弱点和弊病，使得事业单位财务收支管理缺乏有效的控制和监督，甚至发生严重超支等浪费现象，亟待在相应的治理措施方面进行研究和探讨，以有效制止和改变这种状况。
　　 一、支出约束制度化
　　 行政事业单位的行政职能决定了其不能完全市场化。由于管理体制的局限，我国事业单位一般只对争取国家财政资金投入表现积极，管理意识与机制却相对薄弱。特别是财务支出缺乏有效的约束力，表现在费用支出无计划、无定额,或计划定额只流于形式。在资金分配方面，存在严重的随意性，“以哭求奶”的情况较为普遍。在资金使用方面，有的单位支出控制不严,超支浪费现象严重,超标购买小汽车、公款旅游、公款吃喝、公款进行高档消费现象屡见不鲜。有的单位在项目支出资金管理使用中,基本支出和项目支出界定不清,用项目支出来弥补基本支出经费的不足,用于维持日常公用支出,没有做到专款专用。财务部门对经费的管理常常是事后核算,忽视了资金使用前的预测和使用中的控制,对经费收支的考核也只是停留在表面平衡上,很少对资金使用效率实施考核。因此,资金的使用效率普遍低下。
　　 这些问题存在的原因主要在于一些单位内部管理制度不够完善。有的内部未设专门的财务管理机构，内部审核监督仅由一人或多人专职或兼职代理。有的内部未实行统一的财务管理。有相当一部分单位未设内审机构，已建立内审机构的不能发挥应有的作用。但更多的还是流于形式。已订立的制度只用来应付有关部门的检查审计，内部监督执行大打折扣。遇到具体问题时强调灵活性，忽视原则性，使内部控制制度有名无实。有的把行政事业性收费、项目支出分散到科室管理，严重违反了“收支两条线”的财务管理规定。要改变这种状况,必须建立有效的支出约束机制。
　　 1.健全财务制度,强化内部控制力度。行政事业单位要根据《会计法》及《内部会计控制规范》的要求,健全内部控制制度,并涵盖单位内部的各项经济业务、各个部门和各个岗位。要明确内部各单位和部门的职能性质、各部门及人员应承担的责任范围。在财务机构内部,明确会计事项相关人员的职责权限,要合理分工,建立岗位责任制。事业单位要在国家宏观管理的基础上，结合本单位的实际，建立起切实可行的财务管理制度和会计核算流程。对现金的管理，财产的审批，审批权限的分配，财务计划的制定和实施，资金的筹集和使用，预算的编制、执行、监督和评价都要有明确而具体的规定。对于各种会计凭证、账簿、报表的填制、登记、审核、保管都要有明确的分工,各项核算工作都有专人负责。会计人员要按照《会计法》的规定,正确运用事业单位会计制度,准确核算经济业务,落实审核、复核制度,正确地反映事业单位各项经济业务事项。对薄弱环节和重要岗位要加强控制，细化责任，做到制度管人、责任到人。所有资产都要定期核对，切实做到账实相符。以应用完善的单位内部控制制度约束财务行为，减少或避免各种违反财经纪律问题的发生。
　　 2.严格预算管理，加大预算约束力度。预算工作贯穿于财务管理工作的始终。事业单位应坚持实行预算内外综合统筹，编制好财务预算收支计划，将全部收支编入预算。并进一步细化预算收支项目，落实政府收支分类改革措施，切实保证预算与实际相符。同时，制定相应的具体的管理办法和措施，以保证国家资金的合理使用。在执行过程中,可通过内部控制制度确实约束财务行为。在岗位分工控制环节,要保证不相容职务相互分离。在授权批准控制环节,要严格遵循授权范围和权限,重大会计事项建立集体审批制度。在财产清查控制环节,要采取定期盘点的措施确保资产的安全完整。在电子信息技术控制环节,要加强电子信息系统的开发和维护,尽量减少人为操纵因素的影响。理顺管理中的方方面面的财务关系，维持单位的正常运转。通过切实可行的措施加强资金管理，用好用活资金，正确筹划和测算现金流量。特别要加强对专项资金使用的监督和管理，确保专款专用，提高专项资金的使用效率。
　　 预算管理要彻底改变“只重预算执行，忽视编制和评价工作”的预算管理方式，坚持预算编制、执行、评价并重的原则，以确保部门预算编制的科学与合理。要建立健全科学评价体系，广泛采用最低成本法、成本―效益分析法等方法进行评价分析，为管理决策提供科学依据。内审部门经常对内部控制制度进行评价,及时发现内部控制的薄弱环节，制定相应的改进措施。
　　 二、会计核算集中化
　　 会计集中核算形式是一种新型财政管理模式，是加强财务、财政资金治理的一项新举措，对于提高财政理财能力和会计工作效率，规范会计行为，加强会计监督和廉政建设都有十分重要的意义。我国预算会计是以现金制为基础,其目的是汇报支出,为决算服务。目前事业单位的会计核算有许多不当之处。其一，不进行成本核算,因而无法计算和统计行政成本,也无法评价资金的使用效益。其二，有的预算单位对项目支出的核算不区分不同的专项项目资金,统一使用规定的行政事业单位的科目核算,不利于专项项目资金的管理;而有的单位则只按专项项目归集各项费用,不按科目核算,不利于单位各项费用的整体控制管理。其三，现行预算单位会计制度在会计科目的设置和核算内容上,与部门预算编报口径不一致;一般预算支出科目与行政事业单位科目不一致,导致在编制决算时,预算单位必须将会计科目合并或拆分后才能得出预算科目。因此，必须实行会计核算的集中化。
　　 1.通过会计集中核算规范财务收支。首先,实行会计集中核算，行政事业单位大大减少了财会人员，节约了经费开支。其次,使会计人员具备了依法独立理财的环境，行政事业单位的会计业务纳入会计中心统一核算，中心选配业务素质较高的专职会计人员，与被纳入核算单位没有任何依附关系，大大减少了会计工作的行政干预。第三,会计核算中心运用会计电算化网络系统，严格按照国家统一的会计制度进行核算，有利于加速会计电算化步伐，完善现行事业单位的会计科目体系,可以让管理者与使用者更清楚地看清资金的使用去处，为会计管理的实施提供更为方便的条件。第四,会计集中核算以后，财政部门的监督领域得到进一步拓展，通过会计核算中心，实现了财政对核算单位资金收付全过程监管，特别是对支出的方向、结构、规模等方面的监督，把许多不合理的支出消灭在萌芽状态。各核算单位的财务行为得到进一步规范，改变了过去资金使用上的随意性，增强了财务收支活动的规范性，避免了多头开户、多种账户、多渠道流出等现象的发生，提高了各核算单位自我约束，自我监督的自觉性，堵塞了一些单位少扣税或不扣税的漏洞，切实发挥会计核算作用，增加了财政收入。




　　 2.通过会计集中核算实现财务高效管理。事业单位会计集中核算，通过改变会计人员管理体制和会计业务处理程序，可以强化会计核算和会计监督，从源头上遏制行政事业单位腐败，杜绝胡乱花钱、铺张浪费现象，达到提高财政资金使用效益的目的。事业单位会计集中核算的方式，以资金控制为目标，以加强财务收支监督为重点，可以成立会计核算中心，以高效理财为取向，将所有账户及会计业务处理权集中到会计核算中心，进行统一核算和管理，力求核算、管理、监督成本最小，效率最高。
　　 三、核算模式多样化
　　 从目前的情况来看，在我国的事业单位中，多种经营和自收自支类型占有一定的比例。这些事业单位依靠自身的人力、物力和技术力量进行经营活动和创造盈利，已不属于事业单位服务活动的内容，而是属于企业经营性质和行为。此类事业单位的财务收支管理还缺乏规范。有的收费使用非正式的收据或串用行政事业性收款收据等进行收费。有的将收入切块另设账目核算，形成“账外账”、“小金库”以掩盖其真实的收支规模。还有部分单位的经营服务性收费项目未能足额缴纳相关税金。还有的是未严格执行收费票据管理监督制度规定。其核算模式的规范应视其经营规模的大小和经营特点来实行多样化的核算形式。
　　 1.主管部门核算模式。即事业单位的各种财务决策权均完全集中在主管部门，各事业单位及其内部机构都必须严格执行主管部门的决策，各事业单位及其内部机构只负责短期财务规划和日常经营管理。
　　 2.独立核算模式。一些事业单位用自己的固定资产、人力、技术搞经营，而且收入较大的，可实行公司形式，由事业单位单独出资或与职工或吸收外来资金组成公司，单独核算，按资本大小分红。主管部门只保留对事业单位重大财务事项的决策权或审批权，而将人、财、物、产、供、销等日常财务事项的决策权与管理权下放到各事业单位，各事业单位只需将决策结果提交主管部备案即可。在这种模式下，事业单位相对独立，主管部门不直接干预各事业单位的生产经营与财务活动。但必须要把事业单位的正常业务活动与经营活动严格区分开来，在人员的安置上，不允许相互兼职；在管理上，投资的管理与事业单位内部的业务资金活动严格区分，所收股利或管理费用应按规定弥补事业经费之不足。
　　 3.财务人员代管方式。对于事业单位利用自身资源如出租部分房屋收取的租金、转让技术和人力的收入，可以不单独核算，由事业单位财务人员代管，但必须另设账户，独立管理，收入要入账，支出要审批，不得用这些收入私设小金库,或用于请客送礼和职工福利的发放。